La biblioteca greca e quella latina assieme al Cortile delle Biblioteche e alla villa repubblicana costituiscono la più antica area del Palazzo.

I due edifici sono stati considerati erroneamente delle biblioteche, in realtà sono dei triclini a torre che si sviluppano su diversi piani; la biblioteca invece si trova in una sala adiacente ad essi ed è caratterizzata da nove nicchie scavate nella parete che contenevano armadi per i libri.

La biblioteca latina si trova ad est del Cortile delle Biblioteche ed è formata da due stanze precedute da un vestibolo con la facciata curva. La prima stanza ha un piano quadrato e delle alcove su tre lati; inoltre è coperta da una volta a croce. La seconda stanza invece è caratterizzata da una volta a botte.

La biblioteca greca è anch'essa composta di due stanze; la prima ha quattro alcove mentre la seconda si eleva su due piani.