Oltre il Canopo si estende una zona riconosciuta come l'accademia; essa non è stata ancora del tutto scavata, ma le parti visibili sono ammirevoli per le architetture che si combinano perfettamente con il verde degli ulivi vicini.

La zona meglio conservata è il Tempio di Apollo, una vasta sala semicircolare a due piani e sormontata da una cupola; all'interno di essa ci sono delle mezze colonne in mattonella e delle nicchie rettangolari, inoltre sono state trovati alcuni dei più famosi lavori d'arte della villa (i Centauri di marmo nero ed il Mosaico dei Colombi).

La bellezza della zona e la ricchezza delle decorazioni hanno fatto pensare che questo complesso potesse essere la residenza dell'imperatore.